海南汉族、黎族HLA基因多态性的研究
【作者】 唐秋萍
【关键词】 海南汉族 海南黎族 HLA等位基因 多态性 基因频
【导师姓名】曹开源
【学位名称】硕士
【学位年度】2009
【学位授予单位】暂无
【所属分类】Q343.1,I236.66,Q346
【录入时间】2009-01-01
【摘要】是白人中较为常见的抗原，但在东方人中频率很低；东方人中常见的HLA-B46、HLA-DR9在白人中却十分罕见。因此，HLA系统在人类遗传学上成了一个极好的群体标志，可作为不同种群特征性的基因标记，对研究种族起源、迁移、混杂具有重要的作用，同时HLA还是调控人体特异性免疫应答和决定疾病易感性个体差异的主要基因系统，研究HLA的多态性，积累不同民族的HLA基因频率和单倍型频率资料，有助于寻找疾病易感基因，还可根据HLA的基因频率推算出在一定数量的供者中找到HLA相同者的机会，据此建立骨髓供者库，多态性的复杂还可为法医学鉴定提供依据。 传统的HLA多态性分析采用的是血清学分型技术，但血清学分型方法因其分型血清来源困难、存在交叉反应、以及易受B淋巴细胞的纯度与活力、补体质量等因素的影响，用血清学分型方法可能得出错误的结果，随着分子生物学技术的发展，尤其是聚合酶链反应技术(PCR)的发明以来，HLA多态性的研究已进入DNA水平。 因此本课题应用聚合酶链式反应一序列特异性引物( polymerasechain reaction-sequence specific primers，PCR-SSP)技术对海南汉族、黎族HLA等位基因进行分型，从基因水平上研究这两个民族群体的HLA多态性，阐明其HLA等位基因分布特征，为研究海南汉族、黎族的起源、迁移、混杂及与其他民族的亲缘关系提供有价值的遗传学依据，并为进一步开展HLA等位基因与海南地区高发疾病(如鼻咽癌、地中海贫血、Citrin遗传缺陷病等)相关性、器官移植配型、法医学等研究提供一套比较完整准确的HLA-A、B、DRB1基因频率参数。 方法： 随机分别采集3140名和301名3代以上均为海南当地汉族和黎族健康、无血缘关系，年龄18～45岁的捐献造血干细胞血样者ACD抗凝血5ml，提取DNA，按试剂盒操作说明书扩增特异性基因片段，扩增产物经2％琼脂糖凝胶电泳，在紫外凝胶成像系统观察并记录阳性条带，将阳性条带输入试剂盒提供的分型软件判读分型结果，用SPSS13.0软件统计分析各等位基因频率，计算公式为基因频率=1-(1-表 型频率)1/2，其中表型频率是等位基因的检出数除以检测样本总数，并将海南汉族、黎族HLA-A、B、DRB1等位基因频率与其他民族和地区的HLA等位基因频率进行比较。 结果： 1.在海南地区汉族人群中共检出58种HLA-A、B、DRB1等位基因。其中HLA-A等位基因17个，HLA-B等位基因28个，HLA-DRB1等位基因13个。HLA-A基因座具有较高基因频率的等位基因有(pi>0.1000) A*11、A*02、A*24、A*33，低频率等位基因(pi0.050)为B*40、B*15、B*13、B*46、B*58，低频率等位基因(pi<0.0010)有B*14、B*41、B*47、B*50、B*53、B*67，未检出的基因有B*45、B*49、B*59、B*73。DRB1*15 (0. 1649)、DRB1*12(0.1414)、DRB1*04(0.1336)、DRB1*09 (0.1287)则是HLA-DRB1座位具有较高频率的等位基因。与国内其他汉族群体比较提示虽然有些等位基因的频率存在显著性差异，但海南汉族与福建汉族、广东汉族、南方汉族、客家群体的常见HLA-A、B、DRB1等位基因频率分布特征基本一致，A*11、B*46、B*58及DRB1*07分别呈现出由南向北和由北向南的递减趋势，提示海南汉族在HLA基因遗传背景上归属于以广东、福建汉族群体为代表的南方汉族，而与北方汉族则存在显著差异。 2.在301名海南黎族个体中检出HLA-A等位基因11个，HLA-B等位基因20个，HLA-DRB1等位基因13个，其中HLA-A*11(0.3634)、 A*02(0.2507)、A*33(0.1767)、A*24(0.1451)四个等位基因的频率大于93％，是海南地区黎族群体中HLA-A基因座位的主要基因。HLA-B基因座最常见等位基因为B*58 (0.1972)、B*13(0.1788)、B*40(0.1278)、B*46(0.1259)。HLA-DRB1座位检出较高频率的等位基因有DRB1*03(0.1808)、DRB1*15(0.1667)、DRB1*16(0.1627)、DRB1*09(0.1240)。未检出的HLA-A座位等位基因有：A*25、A*34、A*36、A*66、A*68、A*69、A*74，未检出的HLA-B座位等位基因有：B*18、B*41、B*45、B*47、B*49. B*50. B*57、B*59. B*67、B*73、B*81。与南方汉族、广西壮族等人群比较，海南黎族HLA-A*01、A*03、A*30、A*31、B*07、B*08、B*37、B*44、DRB1*01、DRB1*07呈现低频分布，而HLA-A*11、B*46、B*58则具有较高频率，分别呈现由北向南和由南向北递减趋势，与南方汉族及南方少数民族如壮族、布依族等人群呈现一致性。海南黎族与南、北汉族、壮族、布依族、傣族、维族、回族人群HLA-A、B、DRB1基因频率比较差异皆有统计学意义，但更接近于南方汉族、壮族、布依族、傣族及回族。 结论： 1.海南汉族HLA等位基因分布特点提示海南汉族的群体遗传背景总体上虽与南方汉族具有相似性，但可能在海南汉族形成的漫长过程中同时还受到北方汉族的影响，以及由于环境变化、人群迁徙融合等因素致使其HLA基因分布形成自身特点。 2.海南黎族在HLA分布上属于南方民族类型，与西南少数民族壮族、 布依族、傣族具有相似的遗传基因背景，但可能黎族在进入海南岛之后，由于地理位置和交通阻隔的原因，与其他民族较少融合，种族繁衍长期较为单纯，因此出现了选择优势，并且在长期进化中形成自己的优势基因。...
【外文摘要】暂无...